Evropská komise definuje pojem makroregion jako „oblast zahrnující území několika států nebo regionů, které spojuje jeden nebo více společných znaků či výzev.“ Následně lze definici makroregionální strategie rozvést tím, že jde o integrovaný rámec, který dovoluje EU a členským státům identifikovat potřeby a alokovat dostupné zdroje tak, aby mohl makroregion dosáhnout udržitelného životního prostředí a optimálního hospodářského a sociálního rozvoje.

Cílem makroregionálních strategií tedy je vytvořit rámec pro spolupráci, která by vedla ke konkrétním odpovědím na výzvy, kterým makroregion čelí, v podobě projektů či provázanější spolupráce. Jde tedy o průřezový nástroj pro lepší horizontální koordinaci, synergii existujících aktivit a efektivnější a integrované využití dostupných finančních nástrojů a fondů EU i dalších zdrojů.