Pracovní výbory
Stálé pracovní orgány Bezpečnostní rady státu:
- Výbor pro koordinaci zahraniční bezpečnostní politiky (v gesci ministra zahraničních věcí)
- Výbor pro obranné plánování (v gesci ministra obrany)
- Výbor pro vnitřní bezpečnost (v gesci ministra vnitra)
- Výbor pro civilní nouzové plánování (v gesci ministra vnitra)
- Výbor pro kybernetickou bezpečnost (v gesci předsedy vlády)
- Výbor pro zpravodajskou činnost (v gesci předsedy vlády)
Pracovní orgán Bezpečnostní rady státu pro řešení krizových situací
- Ústřední krizový štáb (v gesci ministra obrany v případě vnějšího vojenského ohrožení České republiky, při plnění spojenecných závazků v zahraničí a při účasti ozbrojených sil České republiky v mezinárodních operacích na obnovení míru a udržení míru nebo v gesci ministra vnitra v případě ostatních druhů ohrožení České republiky, při poskytování humanitární pomoci většího rozsahu do zahraničí a při zapojení České republiky do mezinárodních záchranných operací v případě havárie a živelních pohrom)